在大禹陵碑左前甬道南側，有平屋二進各三間，坐東朝西，謂之“禹祠”。歷史上禹祠幾經興廢，現有禹祠部分為1986年新建于原大禹寺遺址部分地面。禹祠是禹的第六代子孫無余所建。后來作為供奉、祭祀大禹及其后代的宗祠。
1986年
新建禹祠
現大禹陵
禹祠
第一進
姒氏世譜
大禹姓姒，名文命，字高密。相傳夏代少康封庶子無余于越，以奉禹祀，無余后裔世代守陵，延續至今。建祠定居成“禹陵村”，故被譽為“中國第一守陵村”。禹祠內第一進中的《姒氏世譜》即是記敘了紹興禹陵這支姒姓家族自夏至清末的世系譜書。
禹祠中的《姒氏世譜》首編于何時無從考證，重修記載最早見于明代。現存譜書是清代光緒元年的修訂本。2003年，大禹后裔姒元翼、姒承家著《大禹世家》，對《姒氏世譜》進行了較為細致的考證，紹興禹陵姒姓至今已傳至146代。
4000多年來，這個家族一直以“活化石”的姿態頑強地守護著大禹，并把這一承諾化為一種精神，融入姒族人的血液中，成為姒姓人獨特的人格魅力。
第二進
大 禹 像
禹祠內的大禹塑像是根據山東嘉祥縣出土的漢武氏墓群石刻《大禹治水》所塑造。
大禹像頭戴斗笠，右手持短柄插臿形工具，此是根據《論語.?泰伯》孔子對他“卑宮室而盡力乎溝洫”的評價而來。可以看到畫面上的大禹有短髭，身向右，但面朝左。頭上所戴之冠呈三角形，似半笠狀。有人考證，大禹所戴之冠即《禮記?郊特牲》所說的“毋追”。如同商代的“章甫”，是夏代服制的特征。
在禹祠第二進門側，有一塊《禹穴辨碑》。該碑為清康熙會稽知縣昝霨林書。昝霨林在此碑中表述了他所理解的“禹穴”。
自司馬遷“年二十，南游江淮，上會稽，探禹穴”以來，禹穴的含義、禹穴所在地，多有爭議。
其一意為禹葬身之處。另有一解釋為禹藏”金簡玉字“之處。唐寶歷中，鄭魴于宛委山書”禹穴“二字，元稹銘而鄭魴序之。鄭魴序云：“禹探神穴，得開之符而成厥水功。”意謂禹在此得黃帝水經，按而行之，才使治水成功。唐賀知章《龍瑞宮記》亦云：“黃帝藏書，磐石蓋門，封宛委穴。禹至開，得書治水，封禹穴。”均以為上述所云之禹穴，乃禹藏書之處，而非禹葬身之所。而禹祠內昝霨林所書正意如此。
內院
禹 井
禹祠內有一古井，謂之“禹井”。《水經注》中有載：“（會稽）山東有湮井，去廟七里，深不見底，謂之禹井，云東游者多探其穴也。宋王十朋《會稽三賦》卷三：“今禹寺后有禹井，謂禹穿鑿，故名。”
南宋嘉泰《會稽志》云：“禹井在縣（會稽）東南會稽山 。”
《吳越春秋》徐天祜注引《地理志》曰：“會稽山上有禹井，相傳下有群鳥耘田也。”
《越絕書?記地傳》“祀白馬禹井。井者，法也。以為禹葬以法度，不煩人眾。”這里提到的“禹井”，就是我們在《中國法制史》中常常引用的《左傳》昭公六年：“夏有亂政，而作禹刑”。
“群鳥耕田”說
《史記·夏本紀·集解》引《地理志》曰：“會稽山上有禹井、禹祠，相傳以下有群鳥耘田者也。” “鳥田”相傳為天報禹之功而有此田。《吳越春秋》卷六：“禹崩之后，眾瑞并去。天美禹德，而勞其功，使百鳥還為民田，大小有差，進退有行，一盛一衰，往來有常。”
大禹陵景區 裘航 文 圖
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